首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
相似文献
 共查询到20条相似文献,搜索用时 656 毫秒
1.
本文选取人的α螺旋和β折叠规则二级结构,计算其中所含亲-疏水性氨基酸的多肽片断,找出多肽片断分布规律,并给出多肽片断在规则二级结构中的位置。  相似文献   

2.
本文对6819个相似性小于40%的7个结构类的蛋白质序列进行分析、整理,给出五类超二级结构序列模式α-α、α-β、β-α、β-β hairpin和β-β link共61824个;并根据Loop的长度进一步分类,建立了相应的蛋白质超二级结构数据库,最后对五类超二级结构中loop序列的氨基酸使用进行了统计分析,并与相关工作做了比较.  相似文献   

3.
酶是一类具有催化功能的蛋白质,对其结构和功能的研究是非常有必要的。特殊模体β-发夹是一种简单的超二级结构,它们包含了丰富的折叠信息,对酶中β-发夹的预测有助于酶结构和功能的预测。本文建立了非冗余的β-发夹模体数据集,包含1080条酶蛋白质链,2818个β-发夹模体,1098个非β-发夹。提取位点亲疏水组分及位点亲疏水紧邻关联组分作为参数,运用矩阵打分算法得到的预测结果不理想。将位点亲疏水、位点亲疏水紧邻关联组分为参数得到的打分值和平均化学位移值共同作为特征参数,输入支持向量机算法对模体进行预测,5交叉检验预测总精度是81.8%,相关系数达到了0.636。  相似文献   

4.
参照Kajiwara等人获得的β-胡萝卜素酮化酶cDNA序列设计引物,利用RT-PCR技术扩增雨生红球藻的β-胡萝卜素酮化酶cDNA的完整编码片段并进行了序列测定与分析.结果表明,所获得cDNA序列与Kaji-wara等人报道序列具有96.4%的相似性,蛋白序列具有98.3%的相似性,说明所获得的cDNA序列确为β-胡萝卜素酮化酶的cDNA序列.  相似文献   

5.
L波段发夹型微带滤波器的设计   总被引:1,自引:0,他引:1  
介绍了设计发夹型微带滤波器的基本原理和ADS在L波段发夹型微带滤波器设计中的应用,提供了发夹型微带滤波器中发夹型微带谐振器的间距与耦合系数之关系曲线的求取方法,呈现了模型仿真和EM仿真的两种效果,最后给出了L波段5阶发夹型带通滤波器的设计实例和测试结果。  相似文献   

6.
黄玉环 《可乐》2011,(2):33-33
国王有七个女儿,这七位美丽的公主是国王的骄傲。她们那一头乌黑靓丽的长发远近皆知。国王送给她们每人100个漂亮的发夹。一天早上,大公主醒来,一如往常地用发夹整理她的秀发,却发现少了一个发夹。她偷偷地来到二公主的房里,拿走一个发夹。二公主发现少了一个发夹,便到三公主房里拿走一个。三公主发现少了一个发夹,偷偷地拿走四公主的。  相似文献   

7.
本文主要利用LiGang和Sumi[3]建立的不动点定理,在Banach空间中,给出关于渐近非扩张映像Tn的显式迭代序列:yn+1=βnf(yn)+(1-βn)T(tn)yn收敛问题.在适当条件下,证明了该显式迭代序列强收敛于这一个渐近非扩张映像的不动点.其结果改进和推广了引文中相应的结果.  相似文献   

8.
识别蛋白质二级结构片段,实质上是从序列片段的水平上对二级结构进行预测.用离散量的方法,通过一系列的计算发现:选择氨基酸(20种氨基酸加一个空位)和其紧邻关联共同为参数,从N端截取固定长序列片段为6或7个连续氨基酸残基时,10交叉检验平均预测精度能达到75%~77%,jack-knife检验平均预测精度能达到72%;当固定长序列片段为9或10个连续氨基酸残基时,10交叉检验平均预测精度能达到82%~83%,jack-knife检验平均预测精度能达到74%~76%.  相似文献   

9.
据GeneBank91资料库,对氨基酸的亲-疏水性及分子大小的使用偏好进行 了统计分析,发现它们与蛋白质的结构及折叠密切相关,同时分析了癌基因的三个 家族,并与普通序列进行了对比.  相似文献   

10.
采用芴甲氧羰基(Fm oc)固相肽合成法(Fm oc-SPPS)合成了血清胸腺因子(FTS),用中压液相阴离子柱一步纯化,经HPLC分析纯度,通过质谱和氨基酸序列测定鉴定合成产物。根据FTS恢复胸腺切除小鼠的脾细胞对免疫抑制剂AZ敏感的特性测定合成FTS的活性。结果表明:化学合成血清胸腺因子的产率为94.7%;纯化后其纯度达到93.7%;质谱测定其相对分子质量为876.6,与理论分子量相符。氨基酸序列测定为NH2/G lu-A la-Lys-Ser-G ln-G ly-G ly-Ser-A sn,与设计序列一致。实验显示在合成FTS的浓度为1-0 14m o l/L时尚有部分活力,在1-0 13m o l/L时能够完全恢复胸腺切除小鼠的脾细胞对AZ的敏感性。  相似文献   

11.
规则二级结构中亲-疏水氨基酸的紧邻关联特性对不同类蛋白质有不同的规律,但在同类蛋白质同类规则二级结构不同长度的片断中有相同的规律,并且亲疏水氨基酸的关联特征是可以定位的,那么次邻关联、次次邻关联是否也有此规律呢?本文对此进行了讨论。  相似文献   

12.
姜荷花是国内新兴的一种热带花卉,其不育苞片尖端带有由叶绿素形成的绿色沉着,严重影响观赏效果.获得叶绿素降解关键酶基因信息有利于后期通过分子育种手段来改良苞片的颜色.为了获得叶绿素降解的关键酶基因PAO信息,本试验在前期通过姜荷花全长转录组测序获得大量转录组信息的基础上,进行筛选分析,获得了2条PAO基因,分别命名为PAO1和PAO2.PAO1基因(Gen Bank:MT077180),c DNA序列全长1 794 bp,开放阅读框1 611 bp(10 bp~1 620 bp),编码一条536AA的氨基酸序列.PAO2基因(Gen Bank:MT077181),c DNA序列全长1 843 bp,开放阅读框1 611 bp (10 bp~1 620 bp),编码一条536AA的氨基酸序列.PAO1和PAO2的氨基酸序列,仅存在4个氨基酸残基的差异.采用Blast,Translate tool(Ex PASy),Clustal Omega,Find Conserved Domains(NCBI),ProtParam,TMHMM Server,SOPMA,SWISS-MODEL,Clustal X(1.81),MEGA4.1等预测和分析了这2个基因编码蛋白氨基酸的一级结构(包括氨基酸序列的组成、保守区、理化特征等)、二级结构、三级结构及分子系统进化关系.PAO1和PAO2的核苷酸与蛋白氨基酸序列与其他物种的PAO基因都具有很高的同源性,两者都包含PLN02518的保守区.分子系统进化分析表明,姜荷花的PAO1和PAO2组成的小类,与小果野芭蕉PAO(XP_009398041.1)的亲缘关系最为接近,然后与禾本科植物的PAO聚为一大类.本研究为后期通过分子手段改良姜荷花不育苞片的颜色提供基础,并为进一步丰富和探索叶绿素降解代谢理论提供铺垫.  相似文献   

13.
研究抑制序列S160对基因表达的影响。首先将hKv4.3基因5非翻译区的一段序列(+2~+160,S160)以不同的方向和位置克隆到报告质粒pβ-gal-promoter vector中,瞬时表达,之后进行β-galactosidase相对活性分析。结果表明S160对基因表达具有强烈的抑制作用,且抑制序列S160的抑制功能具有位置特异性,没有方向特异性。  相似文献   

14.
本研究运用RT-PCR技术,首次从大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)的肌肉组织总RNA中成功克隆了RPS24(Ribosomal Protein S24)基因的表达序列,并对其进行了测序及初步分析.结果表明:大熊猫RPS 24基因的表达序列全长为431bp,开放阅读框(ORF)为399bp,编码132个氨基酸的蛋白质,该蛋白的分子量为15.3251kD,pI为10.92,含有7种类型共14个功能位点:即1个N-糖基化位点、2个cAMP和cGMP依赖性蛋白激酶磷酸化位点、6个蛋白激酶C磷酸化位点、1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、3个N-酰基化位点、1个酰胺化位点及1个RPS 24e sig-nature.进一步分析发现,大熊猫RPS 24基因与已报道的人、牛、苏门答腊猩猩、褐家鼠和小家鼠5个哺乳动物物种的表达序列及其编码的氨基酸序列具有很高的相似性:编码序列同源性分别为94.1%、92.4%、94.7%、89.9%和90.4%;与人RPS 24蛋白的氨基酸序列同源性为98.48%,其余均为99.24%.  相似文献   

15.
从土壤中筛选得到两株产α-淀粉酶的枯草杆菌QSH4株和SHX6株.根据枯草杆菌168株的淀粉酶基因设计引物,对QSH4、SHX6株的α-淀粉酶基因进行了克隆及测序.结果表明两株菌的α-淀粉酶基因碱基数目相等,均为1948bp.两者的碱基序列具有99.90%的同源性.QSH4株和SHX6株的α-淀粉酶基因碱基均较168株酶基因缺失了35 bp(靠近3'-端),另有28个位点的碱基不同,与枯草杆菌168株α-淀粉酶基因之间有96.97%的同源性.由淀粉酶基因测序结果推测QSH4株和SHX6株的α-淀粉酶蛋白由477个氨基酸组成.与168株的α-淀粉酶蛋白(660个氨基酸)相差183个氨基酸.由此推断酶活性中心可能位于酶分子的N-端的3/4肽段.  相似文献   

16.
从信息学的角度,对人(Homo sapiens)的117个蛋白质和大肠杆菌(Ecoli)的185个蛋白质的各二级结构相对应的mRNA序列中的密码子上下文关联、蛋白质序列中氨基酸上下文关联作了统计分析,计算了各二级结构中密码子(氨基酸)上下文关联的信息剩余.结果显示,同义密码子关联有着不同于氨基酸关联偏好的反常现象,人和大肠杆菌蛋白质中反常的密码子分别占19%、16%左右;并对大肠杆菌中的稀有密码子的关联进行了讨论,发现稀有密码子的关联偏好Sheet和Coil二级结构.  相似文献   

17.
从蛋白质一级序列出发,以氨基酸紧邻关联为参数,用离散量的方法,采用5交叉检验,对蛋白质中的strand-loop-strand模体进行了分类.文中使用了两个数据库,采用了不同的截取方式和序列模式长,均得到了较好的预测效果.  相似文献   

18.
大肠杆菌同义密码子重复序列中密码子的使用   总被引:1,自引:0,他引:1  
以大肠杆菌基因组为样本,研究同义密码子重复序列与ORF全序列中各密码子相对使用频率的差异,分析同义密码子重复序列中密码子重复的偏好.结果表明部分密码子的使用与ORF全序列中的使用不同,并非所有密码子的使用与基因表达水平正相关;同义密码子重复序列中密码子重复具有偏好性,部分密码子重复在四联体中有位置偏好.同义密码子重复的最大长度与所编码的氨基酸亲疏水性质、简并度及构成密码子的碱基性质有关.  相似文献   

19.
发夹     
打开抽屉,里面有一对一模一样的发夹。它们都是银粉色的星星形状,就连上面的“钻石”位置、大小和数量都一样。可是,看到如此惹人喜爱的发夹,却令我十分地内疚。在暑假里,从天津到我家串门的姑父带来了一个与我年龄相仿的小女孩儿,她叫晶晶,才比我小半个月。她大大的眼睛,弯弯的柳叶  相似文献   

20.
本文试图对戏剧表演教学实践中的片断教学这一重要环节展开讨论,并且通过深入研究片断教学的核心内容,即名剧片断的排演,以此来激发表演教育工作者们对名剧片断排演这一对于培养学生的表演技能和艺术涵养都具有深远意义的教学阶段的重视与热情,并且对该教学阶段的前景进行合理展望,提供相关的实践参考。  相似文献   

设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号