蛋白质折叠速率预测模型的鲁棒性分析

现代分子生物学中的重要研究内容之一,是通过对蛋白质折叠速率的精确预测来解析蛋白质折叠机制。能够发现影响蛋白质折叠速率的新因素,对于研究蛋白质折叠具有重要意义。最近,本研究组给出一个研究蛋白质折叠速率的新参数——累积主链扭角(Cumulative Backbone Torsion Angles,CBTA)。已有的研究表明,CBTA与蛋白质折叠速率之间有很高的相关性。在新近收集的包含112个单域球蛋白质折叠速率的实验资料集上,从预测精度、鲁棒性和泛化能力等几个方面,全面地比较了包括CBTA模型在内的四个典型的折叠速率预测模型。结果表明,CBTA模型表现最好。同时还表明,就目前的实验数据量不足以构建基于多因素的蛋白质折叠速率预测模型。     

耦合二级结构数和非局域相互作用预测蛋白质折叠速率

寻找改进蛋白质折叠速率可预测性的经验参数,是理解蛋白质折叠机制的重要途径之一。假设蛋白质的折叠元件为天然态二级结构,对折叠元件的组织过程即为折叠。构造了表征折叠自由能垒高度的经验参数——二级结构数与非局域相互作用的耦合(coupling of secondary structure number and nonlocal interaction, CSNI),进一步按照过渡态理论建立了折叠速率预测模型。在现有实验资料集上检验,CSNI模型对折叠速率的拟合优度达到R~2=0.73,相关性优于现有的典型模型,并且由CSNI模型所呈现的折叠自由能景观,为深入理解蛋白质折叠机制提供了见解.     

蛋白质27类折叠子序列的特征分析和预测

通过对27类蛋白质折叠子的统计分析,发现位点氨基酸及氨基酸二肽组分可以在一定程度上反映蛋白质折叠子信息．文中采用整体分类策略．基于离散增量的方法分别以位点氨基酸、氨基酸二肽组分等信息为参数对27类蛋白质折叠子进行了识别研究．为了进一步提高识别的精度,以次邻二肽组分、氨基酸组分、亲疏水和极性氨基酸组分共同作为参数,得到了较好的识别结果．     

时序的折叠

旅美女作家於梨华的小说《又见棕榈,又见棕榈》以出国学成归来的牟天磊博士的爱情故事为线索,描写了无根的一代的空寂、失落、追求。小说表现这一主题的叙事模式引起了的思索,它叙述的脉络仿佛是一根对折起的线。小说共二十章,叙述了牟天磊归国后在去留问题上的抉择,以及与意珊之间的爱情纠葛。 小说在结构上并非从牟天磊大学时写起,更没有展示后立其人及其与天磊间的爱情。实际上是以天磊回国为中点将自然时序向两翼伸展并使两翼折叠相交。只要我们看一看小说各章的主要情节内容就可以验证这一点了。第一章从天磊出国十年后归国写起…     

粗蛋白质测定仪测奶制品蛋白质比较分析

目的:预期掌握目前部分大理产奶制品中蛋白质含量以及非蛋白质氮的含量情况,并与外包装指示含量进行比较与奶制品是否一致。方法:粗蛋白测定法,根据微量凯氏定氮法的原理,测定奶制品中总凝固沉淀物重量,及奶制品中非沉淀物经三氯乙酸处理后取沉淀再采用沉淀重量法测定蛋白质含量并与国家规定标准(简称"国标")进行比较。结果:将调味牛奶、酸牛奶、纯牛奶、奶粉中总含氮物质与真蛋白质的含量进行比较,差异没有统计学意义,蛋白质含量与外包装上标注的蛋白质含量接近一致,蛋白质含量均达到国标以上。结论:目前部分大理产调味牛奶、酸牛奶、纯牛奶、奶粉中不含有非食用氮物质,蛋白质含量与外包装上标注的蛋白质含量接近一致,所测量的部分大理产奶制品的蛋白质含量符合国家奶制品蛋白质含量标准。     

中国外汇储备调整速率的ADL与ECM模型分析

在非均衡框架下研究了中国外汇储备变化的特征,对其自身调整速率进行了动态分析.根据1992-2013年中国外汇储备及影响因素的季度数据,依据局部调整理论,建立了外汇储备规模的自回归分布滞后模型(ADL)与误差修正模型(ECM);通过可行的广义最小二乘法(FGLS)进行回归调整,获得了关于外汇储备长期及短期动态调整速率的基本方程.根据回归结果推算出外汇储备长期的调整速率为16.87％,短期波动偏离长期均衡时,将需8年左右时间以反向调整力度由非均衡状态回到均衡状态.实证结果表明中国外汇储备调整速率偏低,中国外汇储备居高的局面难以短时间解决.     

速率分布函数的讨论

从麦克斯韦速率分布出发,给出了最可几速率和速率分布函数峰值之间的定量关系;指出了任何气体在任何温度下,速率小于最可几速率和平均速率的分子数比率均为确定常数.     

蛋白质等电点的计算

证明了与蛋白质等电点相关的函数是单调函数,并由此给出了等电点的计算方法.     

烟草净光合速率日变化与影响因子的PLSR分析

通过研究一天中不同时间段环境因子(光照强度、环境CO2浓度、气温、相对湿度)和生理因子(叶片温度、胞问CO2浓度、气孔导度和蒸腾速率)对烟草叶片净光合速率日变化的作用,为提高烟草的产量,改进大田栽培技术提供参考.利用Li-6400型光合作用测定系统,测定打顶后的烟草叶片净光合速率及其影响因子的日变化,利用偏最小二乘回归(PLSR)分析方法,分5个时间段讨论各个环境、生理因子对净光合速率日变化的影响.烟草的净光合速率日变化曲线为双峰,峰值分别在出现10:00和15:00,13:00出现低谷.PLSR分析发现,不同时间段,净光合速率所受影响因子存在很大差异;该方法有效地解决了各影响因子之间的多重相关性,合理地解释了不同时间段净光合速率的变化规律及其对影响因子的响应.     

山猪血清蛋白质多态性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析研究

运用聚丙烯酰胺凝胶电泳分析了山猪血清蛋白质生化位点多态性的分布．结果表明，前白蛋白Pa、白蛋白Alb、后白蛋白P0可分离出4～6条区带，转铁蛋白Tf分离出2～3条区带．白蛋白的平均分子量约为69000Da，转铁蛋白的平均分子量约为88000Da．用聚丙烯酰胺凝胶电泳分离血清蛋白质重复性较好，分辨较高，测定蛋白质的多态性和分子量的变化对分析猪的遗传特征、选育优良品种和诊断诸多疾病有重要意义．     

蛋白质谱数据的特征提取

变性蛋白质与正常对照组的蛋白质的HPLC-MS谱图存在人工无法发现的差异性,也是本文所说的特征,本文的研究工作就是通过信息学的方法寻找这些特征。实际工作中,我们先从谱图中提取数据,重新采样,并且对采样数据进行基线校正,归一化,噪声降解,得到预处理好的数据集。然后利用遗传算法来最优化结果,找到了变性蛋白质的特征谱线。我们期望根据这些特征建立未知蛋白质的分类模型,为疾病的诊断提供依据。     

食品安全概念的理论分析

食品安全(Food safety)的定义是食品安全立法的重要基石,也是制定食品安全相关政策,提高食品安全监管绩效的基础性概念.动态地考察食品安全的内涵和外延,通过比较分析食品质量、食品营养、食品卫生等相关概念,并结合鲜牛奶、乳制品质量安全典型案例,分析我国现行主流食品安全概念的局限性,认为食品安全是食品质量的安全性状,而不应包含食品质量的其他形状.这一结论对推进食品安全理论研究,提高食品安全监管水平具有重要意义.     

经济增长的理论分析

经济增长理论这门学科的处理分为迥然不同的两部分:一般论述和极其简单化的符号模型这两者间有着一道鸿沟。任何一种考察单独地都不会令人满意。前一种通常缺少分析;后一种过于狭隘,它的确切性是假的。我们这个体系的需求方面,首先是作为一个独立变数的投资,其次是通过自由支配的收入而与投资结成函数关系的消费,同时考虑或不考虑政府和其他因素(如折旧等)的存在。在生产能力方面,则涉及到:劳动人口的增长及其构成的变化,和其他种种变化,如工作的时间、工人的训练和技能、劳动的数量、制度的条件、地理的变动、资本的积累和广义的技术进步。当经验资料搜集以后,增长理论最直接明了的考察方法是把技术进步和资本积累作为它的两个最重要因素,从正面探讨它们的原因。尽管目前经济增长模型存在着简单化、抽象化、狭隘性等缺点,它们对于了解我们的经济体系的运行,不是完全没有用处。撇开形式数学不谈,要是我们考虑到,生产能力的扩充与投资有关,总需求的增长与投资增长率有关,因而要使经济保持平稳,就须要收入(很可能还有投资)的不断增长;那末,资本主义制度的性质及其逐年保持充分就业的困难就更容易理解了。要是我们进一步观察到,资本量与产量的关系决定于产量增长率(和储蓄倾向),在当前条件下,有一个收入增长率可以保持资本与产量的平衡,从而避免资本的过分积累;那末,投资过度与投资不足,储蓄过度与储蓄不足,利润率下降,投资机会消失等理论就可得到适当的安排。经济稳定将成为经济增长问题的一个特例。     

党建理论的新思想分析

十六大通过的新党章指出 :“中国共产党是中国工人阶级的先锋队 ,同时是中国人民和中华民族的先锋队” ;中国共产党代表中国先进生产力的发展要求 ,代表中国先进文化的前进方向 ,代表中国最广大人民的根本利益 ;“其他社会阶层的先进分子”“可以申请加入中国共产党”。这些新的提法并不意味着中国共产党的性质由工人阶级的政党变成了全体人民的政党即“全民党”。从理论上讲 ,“全民党”是不存在的。“三个代表”思想是与党的工人阶级性质一致的 ,并且是以党的阶级性为出发点的。     

27类蛋白质折叠子的识别及其位点的统计分析

从蛋白质的氨基酸序列出发,采用全体分类的分类策略识别27类折叠子.当使用5种矩阵打分的方法识别27类折叠子时,预测结果并不理想,进一步使用了以矩阵打分方法得到的分值及氨基酸的二肽组分共同作为参数的离散增量算法,取得了较好预测效果.总的预测成功率达到了45.43%.     

思想分析的理论预设

哲学践行是新近发展起来的一个模式或范式。思想分析是应用逻辑的方法对人们进行治疗的活动,它是一种哲学践行。思想分析有其本身的理论预设,它预设了人的思想病症,即"惑",其根源是认知冲突;"惑者"有健全的心灵;思想分析是价值中立的;等等。这些预设是相互关联的,它规定了思想分析的边界。     

中小企业标准的理论分析

中小企业标准的理论界定是一个国际性难题.本文从三个不同的角度考察中小企业的标准问题.一是依据企业规模(企业雇佣人数、企业资产量、企业经营收入)来界定中小企业;二是对我国中小企业的标准进行了历史透视;三是对我国中小企业的重新划分作了定性和定量分析.     

保险监管的理论分析

保险监管产生的主要原因在于市场失灵,包括垄断、公共物品、外部影响和信息不完全。政府对保险业进行监管可以实现交易成本的巨大节约,特别是当投保人的数量越多时,交易成本的节约也就越大。在实践中,由于各国国情、传统和现实变革的不同,政府在监管模式的选择上也呈现出一定的差异性和阶段性,但保险监管的根本目的是要保证保险人的偿付能力,从而最大限度地保证被保险人的利益。因此,有效的以偿付能力监管为核心的保险监管体系,应当建立在强大的保险信息数据库和高效的保险资金运用渠道基础之上。     

财务会计理论框架的分析

财务会计理论框架是构建会计理论体系和指导会计实践的基础。从财务会计基础理论、会计应用理论和会计环境理论三个方面分析了会计目标、会计假设、会计原则、会计要素、会计方法、会计实践、会计检验、会计环境等会计理论构成要素及其相互关系 ,为财务会计理论、会计实践以及会计理论与会计实践的相互结合奠定了一个基本的理论框架