27类蛋白质折叠子的识别及其位点的统计分析

从蛋白质的氨基酸序列出发,采用全体分类的分类策略识别27类折叠子.当使用5种矩阵打分的方法识别27类折叠子时,预测结果并不理想,进一步使用了以矩阵打分方法得到的分值及氨基酸的二肽组分共同作为参数的离散增量算法,取得了较好预测效果.总的预测成功率达到了45.43%.     

蛋白质中四类简单超二级结构的分类

蛋白质超二级结构预测是三级结构预测的一个非常重要的中间步骤。本文从蛋白质的一级序列出发,运用了一种改进的预测算法:以氨基酸组分和紧邻氨基酸分别作为参数,输入离散增量算法的单分类器中,通过加权融合单分类器的计算结果,对四类超二级结构进行了预测,取得了较好的预测结果。四类超二级结构的平均预测总精度达到78.3%,Matthew’s相关系数在0.65以上。     

蛋白质二级结构序列片段的识别

识别蛋白质二级结构片段,实质上是从序列片段的水平上对二级结构进行预测.用离散量的方法,通过一系列的计算发现:选择氨基酸(20种氨基酸加一个空位)和其紧邻关联共同为参数,从N端截取固定长序列片段为6或7个连续氨基酸残基时,10交叉检验平均预测精度能达到75%~77%,jack-knife检验平均预测精度能达到72%;当固定长序列片段为9或10个连续氨基酸残基时,10交叉检验平均预测精度能达到82%~83%,jack-knife检验平均预测精度能达到74%~76%.     

蛋白质27类折叠子序列的特征分析和预测

通过对27类蛋白质折叠子的统计分析,发现位点氨基酸及氨基酸二肽组分可以在一定程度上反映蛋白质折叠子信息．文中采用整体分类策略．基于离散增量的方法分别以位点氨基酸、氨基酸二肽组分等信息为参数对27类蛋白质折叠子进行了识别研究．为了进一步提高识别的精度,以次邻二肽组分、氨基酸组分、亲疏水和极性氨基酸组分共同作为参数,得到了较好的识别结果．     

两种酸根离子配体结合位点的识别

在许多重要的生命活动中,蛋白质功能的执行依赖于蛋白质与配体的相互作用,酸根离子作为一种重要的蛋白质结合配体,其结合位点的识别对于蛋白质功能的研究有着重要意义.本文选取了两种酸根离子配体作为研究对象,提出了基于序列信息的MultilayerPerceptron算法,5-交叉检验下,得到了较好的预测结果.     

蛋白质超二级结构的分类及LOOP序列的统计分析

本文对6819个相似性小于40%的7个结构类的蛋白质序列进行分析、整理,给出五类超二级结构序列模式α-α、α-β、β-α、β-β hairpin和β-β link共61824个;并根据Loop的长度进一步分类,建立了相应的蛋白质超二级结构数据库,最后对五类超二级结构中loop序列的氨基酸使用进行了统计分析,并与相关工作做了比较.     

一种新的卷积反演快速算法

提出了一种新的卷积反演快速算法,比目前常规的快速算法节省运算量,且适应序列的长度为无限的情况.     

人类SSX基因族简介

人类的SSX基因家族包括5个成员:SSXl,SSX2,SSX3,SSX4和SSX5,它们都位于X染色体上.这5个基因有很高的序列同源性:碱基序列有88%-95%同源;所编码188个氨基酸残基构成的蛋白质有77%-91%同源.它们所编码的蛋白质中含有KRAB(Kruppel associated box).SSX蛋白质也是癌/睾丸抗原(CT:Cencer/testis antingns)中的成员.研究SSX基因结构、基因表达等对于肿瘤免疫疗法的建立具有重要意义.     

蛋白质β-发夹模体片断的识别

依据β-发夹氨基酸序列中的保守性特征,分别以氨基酸(20种氨基酸和一个空位)和氨基酸紧邻关联为参数,通过构建位置权重矩阵和选取氨基酸最佳序列模式片断,利用相似性打分函数,对蛋白质超二级结构β-发夹模体片断进行识别,获得了较好的预测效果.     

氨基酸亲-疏水性及分子大小使用偏好的统计分析

据GeneBank91资料库,对氨基酸的亲-疏水性及分子大小的使用偏好进行 了统计分析,发现它们与蛋白质的结构及折叠密切相关,同时分析了癌基因的三个 家族,并与普通序列进行了对比.     

一种预测膜蛋白类型的新方法

本文以紧邻氨基酸出现的频数为参数,用离散增量方法预测了6种类型膜蛋白.并用自洽、留一法和独立检验三种方法对算法进行检验,均获得了较好的预测效果.     

日语人称代词及表达形式探析

日语人称代词词汇量丰富、用法复杂、使用率低;表达形式多样,往往省略或隐含于谓语。日语人称代词的这些特点恰恰成了非日语为母语的学习者的难点。为了正确理解、运用日语,本文对日语人称代词的多样性、所受制约及隐含于谓语等表达形式进行了探析。     

当代世界文化的多样性与统一性论略

人类文化是多样性与统一性的统一体。世界文化的多样性与统一性是辩证统一的。文化的多样性与统一性是同一种文化的两种属性,两者统一于具体的文化形态当中。当代世界文化的多样性与统一性有其时代蕴涵。在经济全球化时代,必须尊重世界文化的多样性和统一性。     

从科学的性别文化到科学文化的多样性——女性主义视域下的科学文化

传统女性主义从性别维度分析传统科学文化,揭示出传统科学文化中存在的性别歧视与科学的＂菲勒斯中心主义＂。受后现代主义与后殖民主义理论的影响,新时期女性主义解构传统科学文化的一元结构,从阶级、民族、地域等方面坚持科学文化的多元立场,女性主义科学文化观从科学的性别文化转向了科学文化的多样性研究。后现代主义对女性身份的消解与后殖民主义对差异性与多元性的强调为女性主义多元文化发展带来新动力与巨大挑战,唯有建立一种使后现代主义的解构、多元主义的差异与女性主义批判完美结合的女性主义文化,女性主义多元文化才能继续发展。     

法学方法多样化在中国法律史教学中的适用

在中国法律史教学中,引入多样化法学方法综合适用,不仅能够克服中国法律史教学中法学方法原有的单一化,严重意识形态化、教条化、封闭化等种种倾向,还可以在各种法学方法之间形成互补。对应对复杂、多维的法律史问题,开阔法学教育的理论视野具有重要的意义。     

失业原因的多方面性与职业教育的职责

失业是市场经济条件下的一种必然现象 ,然而失业的原因是多方面的 ,需要综合治理。论文系统地提出了失业的多种类型 ,并从职业教育与失业治理的关系 ,分析了职业教育可以有效地缓解或减少各类失业的作用 ,建议应把职业教育纳入国家治理失业的范畴     

土家族传统文化的特质

文章认为 ,土家族文化是一种典型的山地文化 ,特殊的地理环境及其山地经济生活促成了土家族勇敢顽强的民族精神、形象的思维方式、乐于助人的美德、乐观浪漫的性格。由于土家族处于中国的腹心地带 ,历来就是各种文化的交汇点 ,加上族群的流动 ,中央王朝强制性的文化渗透 ,使土家族文化呈多元性特征。     

丹巴的墨尔多文化

墨尔多是嘉绒地区的一位名山神,墨尔多神山是嘉绒地区的第一大神山.坐落在丹巴墨尔多神山下的墨尔多庙是一个供奉神祗十分复杂的寺庙,所供神祗有佛教,有苯教,也有道教,呈三教合流状态.墨尔多庙供奉神祗的多样性,是丹巴地区文化多元性的反映.