CARfinder:一个用于识别染色体变异区域的平台软件

癌症是危害人类健康的主要恶性肿瘤之一,因此,研究癌症发病机制,发现癌症的发病的分子学基础,挖掘致病因素,对有效预防和治疗癌症,具有重要的意义。目前,在癌症中发现了大量的染色体畸变现象,已有研究表明,染色体的结构变异会导致癌症的发病与发展,因此识别癌症中的染色体变异现象对了解癌症的发病机制,阐明癌症发生的分子机制有着至关重要的作用。随着,海量的生物学数据的产生,差生了大量的、大规模的全基因组的表达谱芯片数据,这为从全基因的角度识别染色体变异区域提供了可能。为此,我们开发了一个利用表达谱数据识别染色体变异区域的软件CARfinder,并将该软件应用于乳腺癌数据中得到了很好的识别结果。     

基于CGAP数据库研究癌症相关基因在染色体上的聚集特点及对变异区域识别

癌症是严重威胁人类健康的一个重大因素,在癌症中发现了大量与癌症发生、发展相关的染色体畸变区域。如何识别癌症中特异的染色体变异区域成了一个非常重要的课题。癌症基因组剖析计划(CGAP)中提供了大量癌症组织中基因表达情况,为我们从全基因组的角度识别与癌相关的变异区域提供了可能。本文利用了CGAP数据库中数据系统的识别了癌症中的染色体变异区域,得到了准确的识别结果。     

成功破译人类6号染色体

英国科学家日前成功破译了人类第6号染色体,并识别出了多个引发人类疾病的基因.6号染色体解密,对人类征服顽症有何意义?医学基因组学国家重点实验室主任、上海血液学研究所执行所长陈赛娟表示,6号染色体解密,为研究某些疾病的发病奠定了基础."锁定"致病基因是研究疾病发病的第一步,但像肿瘤、心脏病、高血压等一些多基因疾病与多个基因相关,这就要求人类进一步对全部24条染色体进行逐一解读;此外,对一些遗传性疾病的研究还必须掌握其"家系"情况.     

成功破译人类6号染色体

英国科学家日前成功破译了人类第6号染色体,并识别出了多个引发人类疾病的基因。6号染色体解密,对人类征服顽症有何意义?医学基因组学国家重点实验室主任、上海血液学研究所执行所长陈赛娟表示,6号染色体解密,为研究某些疾病的     

利用mRNA分析技术鉴别血液与精液研究

目的:探讨鉴别血液与精液的一种新方法。方法:采集月经血、外周血和精液样本,试剂盒提取样本RNA,反转录试剂盒反转录后得到c DNA,利用挑选的引物进行PCR扩增,检测若干个特定基因m RNA的表达情况。结果:发现月经血中可以同时检测到HBB与MMP11基因m RNA;而在外周血中只检测到HBB基因m RNA;在精液中可以同时检测到TGM4、PRM2基因m RNA。结论:检测MMP11、TGM4、PRM2基因m RNA表达可用于鉴别外周血、月经血和精液。     

多车型车辆路径问题的量子遗传算法研究

本文在分析现有文献中多车型车辆路径问题中车辆使用优先原则的基础上,将车辆使用费用分为固定费用和油耗费用,并建立以配送总费用最小为优化目标的数学模型。设计量子遗传算法对模型进行求解,采用量子比特位设计染色体结构,改进遗传算法中交叉与变异算子,避免优秀基因不被破坏,设计快速寻优机制与最优保留机制,增强的求解效率。最后,结合算例对模型和算法进行了检验与分析。     

漳州地区汉族人群19个STR基因座的遗传多态性研究

目的:调查19个STR基因座漳州地区汉族人群的多态性分布。方法:应用Goldeneye 20A荧光复合扩增系统对553个无关个体的19个STR基因座进行检验分析,进而统计群体遗传学参数。结果:获得19个STR基因座的等位基因频率分布及等位基因数,相关参数为:杂合度观察值(H)为0.5859~0.9241,个体体识别力(DP)为0.7810~0.9851,非父排除率(PE)为0.2743~0.8448,多态信息含量(PIC)为0.5414~0.9075。结论:上述19个STR基因座在漳州地区汉族人群具有丰富的遗传多态性,适用于各类案件的法医学个体识别和亲权鉴定。     

缺失数据下ARMA(1, 1)模型的估计方法

近几十年以来,国际上在对"风险的处理和效益的优化"这两个现代金融学的中心议题的分析和处理过程中,金融时间序列的计量学模型及其相应的分析越来越起到非常重要的作用.对于线性时间序列模型如AR(p),MA(q),ARMA(p,q)等,已经为我们所熟知.具体到模型的参数估计在数据没有缺失时,也有很多经典的办法,如最小二乘法、极大似然法等.但是当数据在中间有缺失时,上述方法将无能为力.本文将详细讨论在数据有缺失时的ARMA(1,1)模型,即Zt=αZ_t-1+ε_t-βε_t-1的参数的估计方法.     

基于在线评论的区域需求偏好识别方法

用户需求存在着区域差异，识别区域需求偏好是企业区域化经营策略的决策基础。为此，本文提出了一种基于在线评论的区域需求偏好识别框架。首先，从在线评论中提取产品特征，并判定产品特征的情感极性；然后，基于特征情感计算客户的产品满意度；最后，利用假设检验的方法识别特征情感极性和产品满意度的区域差异。为了验证框架的有效性，本文利用汽车之家网站上的汽车产品评论数据进行分析。实验结果表明，油耗、空间、外观和内饰等特征的情感极性以及产品满意度受区域因素的影响十分显著。研究结果建立起产品特征情感极性和产品满意度与区域特征的关联联系，为企业的区域化产品设计与营销策略提供理论支撑。     

互联网商品评论情感分析研究综述

互联网评论情感分析是Web信息挖掘的一个新兴领域,近年来受到计算机科学、经济学、管理学等相关学科的广泛关注.目前,情感分析领域的研究主要集中在主观性内容识别、褒贬情感分类以及在线评论的经济价值挖掘等几个方面,大部分研究借鉴文本挖掘、信息检索、机器学习、自然语言处理、统计学等方面的技术和方法,也提出了一些针对评论情感分析的特定方法.对在线评论情感分析领域的研究现状与进展动态进行归纳和分析,重点论述现有研究采用的主要方法和关键技术,以及研究中存在的问题,最后提出了未来的研究方向.     

老年学研究中的重大问题和对策

人的自然寿命有多长自然寿限推算方法有以人的生长期的5-7倍、性成熟期的8-10倍及胚胎细胞分裂次数和周期来估算的,比较公认的是120岁左右。人的自然寿命的极限研究难度在于较难进行跨代际的、纵向的、大样本的、长时间的跟踪观察。长寿基因的是是非非科学家发现,第4号染色体 D4S1565位点上一条狭长的区域可能包括几个长寿基因,且纳入研究的90岁以上老人普     

男性Amelogenin基因异常分析

目的:探讨男性个体牙釉质蛋白基因(Amelogenin)异常时的性别判定。方法:利用chelex-100法提取男性个体血样,分别用Ampf STR Identifile、PowerPlex?16 HS、Goldeneyetm 20A和Ampf STRYfiler Kit试剂盒扩增,AB3130xl基因荧光分析仪进行检测。结果:Amelogenin基因分型为X,Ampf STR Yfiler Kit试剂盒扩增检测获得了Y-STR分型。结论:男性Amelogenin基因异常时需用其它方法判定性别。     

最后一个基因的破译将给我们带来什么?——生命科学进入"后基因组时代"

《人类文明史》上划时代的日子 让我们永远记住这个日子:2006年6月18日. 这一天,将注定是一个人类文明史上一个划时代的日子.这一天,全世界的媒体都以一种罕见的兴奋,报道了这样一个消息:美国和英国科学家在英国《自然》杂志网络版上,发表了人类最后一个染色体--"1号染色体"的基因测序,解读人体基因密码的"生命之书",终于将句号画圆.     

基于影评数据的在线评论有用性影响因素研究

面对互联网上海量的在线客户评论,如何能快速有效地进行识别和选择从而发现和利用其中有用的评论,已经成为人们关注的重要问题.以体验型商品电影的在线评论为研究对象,结合文本挖掘技术和实证研究方法,从文本特征出发探索影响在线评论有用性的因素,建立在线评论有用性影响因素模型,并利用该模型对评论有用性进行分类预测.与现有相关研究相比,提出的模型总体拟合效果显著提高,并发现在线影评中积极的情感倾向、较高的正负情感混杂度、较高的主客观表达混杂度以及较长的平均各句长度,对评论的有用性具有显著的正面影响.最后预测结果表明,该模型对在线影评的有用性具有较强的判别能力.     

项目投资区域风险的识别与预警模式研究

研究指出了项目投资区域风险识别与预警的重要意义,利用聚类分析法系统识别了项目投资所面临的六类区域风险;研究建立了基于界面集成的项目投资区域风险的预警模式,强调战略、组织、方法、信息、文化和过程六要素的有机融合;并基于管理熵理论进一步分析了该预警模式的耦合关系,实现了对区域风险警度的量化。     

从资源角度分析区域经济集聚

区域经济集聚就是以企业为主体的产业区域集群,产业集聚与一定地域拥有的资源相关。长期以来,不论是正统经济学发现的"外部经济",还是经济地理学强调的"区域空间联系效应",抑或是新经济地理学揭示的"报酬递增效应",都注意到了经济集聚下的收益递增事实,但由于缺失了对区域资源特性的分析,往往混淆了集聚的原因与结果。     

基于结构化工作流网的隐含任务挖掘方法

过程挖掘是一种客观、自动化的过程分析技术,它通过挖掘过程日志来得到业务过程的结构模型,是传统过程分析手段的重要补充.如何正确挖掘包含隐含任务的不完整过程日志,是过程挖掘需要解决的难题之一.现有的一些算法如基因算法、α#算法等解决了部分类型隐含任务的挖掘问题,但仍有许多类型的隐含任务无法被正确挖掘.针对这一问题,本文在α#算法的基础上提出了一种基于结构化工作流网的挖掘算法,该算法能够较为完整地挖掘各类包含隐含任务的结构化工作流网模型.通过理论分析和实验验证,该算法的正确性和有效性得到了证明.     

激光捕获显微切割结合低体积扩增技术研究

目的:研究激光捕获显微切割技术联合应用低体积扩增技术,建立一套微量混合样本DNA的检验方法。方法:使用PALM系统切割捕获目标细胞,弹射到低体积扩增玻片的反应位点上,消化细胞,提取DNA,使用Identifiler?试剂盒在1.5μL体系中进行PCR扩增。结果:分别捕获10个口腔上皮细胞、20个精子细胞,成功获得16个完整的STR基因座分型谱带。结论:激光捕获显微切割技术联合应用低体积扩增技术适用于法医学中微量混合样本DNA检验。     

外商直接投资、产学研合作与地区创新绩效 ——来自中国省级面板数据的实证研究

本文构建了外商直接投资、产学研合作的溢出效应和地区创新绩效的分析框架,运用中国省级面板数据进行实证分析,检验了外商直接投资与产学研合作的溢出效应在对区域创新产出和创新效率的影响上存在何种关系(互补/替代)。研究表明:在对区域产品相关创新产出的影响上,外商直接投资与产学研合作作为两类知识获取渠道存在替代关系;在对区域专利相关和产品相关创新效率的影响上,外商直接投资与产学研合作作为两类知识获取渠道存在替代关系。在上述结论的基础上,本文对中国区域创新绩效提升提出了相关的政策建议。     

融媒体视域下新时代大学生文化价值培养的缺失、归因与重构研究

融媒体视域下,对大学生文化价值培养存在文化传统自信、忧患意识、价值认同、主体意识缺失问题,主要是由于高校思政教学、融媒体平台、相关部门机构、大学生自身等思想政治教育主体工作缺失,只有通过挖掘融媒体价值、鉴别融媒体功能、发挥融媒体作用、建设融媒体平台,才能重构对大学生文化价值的培养。