An online copy number variant detection method for short sequencing reads

The availability of the next generation sequencing (NGS) technology in today's biomedical research has provided new opportunities in scientific discovery of genetic information. The high-throughput NGS technology, especially DNA-seq, is particularly useful in profiling a genome for the analysis of DNA copy number variants (CNVs). The read count (RC) data resulting from NGS technology are massive and information rich. How to exploit the RC data for accurate CNV detection has become a computational and statistical challenge. We provide a statistical online change point method to help detect CNVs in the sequencing RC data in this paper. This method uses the idea of online searching for change point (or breakpoint) with a Markov chain assumption on the breakpoints loci and an iterative computing process via a Bayesian framework. We illustrate that an online change-point detection method is particularly suitable for identifying CNVs in the RC data. The algorithm is applied to the publicly available NCI-H2347 lung cancer cell line sequencing reads data for locating the breakpoints. Extensive simulation studies have been carried out and results show the good behavior of the proposed algorithm. The algorithm is implemented in R and the codes are available upon request.     

知识经济时代高师院校图书馆员的素质及培养

本文论述知识经济时代高师院校图书馆员素质的相关问题。     

沈德潜在“诗教”原则下对唐诗的历史定位

沈德潜一生于唐诗用力甚多,唐诗在其诗学理论中占有重要地位。沈德潜重视诗歌史的梳理,也特别注重各时代诗歌所具有的"诗教"之用。唐诗是他对诗歌史进行溯源辨流的起点,也是其考察诗道兴衰的关结点。通过对诗歌史源流正变的清理,沈德潜将唐诗在诗歌自然流变史中的地位和其在诗道兴衰史中的地位结合在了一起进行考察。在诗歌的自然流变中,唐诗虽然处于诗歌发展之流,但又是诗歌之盛;在"诗教"传统中,它又传承了诗教之正。因此,在沈德潜的诗学体系中,唐诗获得了崇高的诗史定位。     

信息不完备不对称危害的治理--兼论技术创新和制度创新

本文对技术创新与制度创新在治理信息不完备不对称所引发的危害中的作用作了探讨。认为技术与制度的创新尤其是制度创新中的特定组织形式的演进能够相对改善信息不对称情形 ,能够有效约束行为人的机会主义行为     

试论殷墟聚落居民的族系问题

殷墟聚落形态研究是这些年学术界共同关心的课题 ,但在殷墟聚落居民的族系这一基本问题本上尚有很大分歧。通过仔细分析当地所出的相关族氏铭文 ,可以发现 ,在商代晚期 ,居住在殷墟聚落内的居民并非是由单一族系的“子”姓族氏组成的 ,当地的居民至少应该包括子姓、姜姓、姓、姓等各个族氏 ,同时也可能有任姓族氏在殷墟聚落内蕃衍生息。     

明成祖的亲王守边政策

以往学界认为 ,明成祖在即位后将塞王内徙 ,以天子守边和总兵镇边取代了藩王守边。但对已发现材料的考察表明 ,在永乐十一年四月以前的大部分时间里 ,成祖之子汉、赵二王曾先后防守北京一带 ;二王拥有较大的军、政权力 ,可以统帅大将 ,抗击蒙古 ,地位接近于洪武末年的塞王 ;永乐初年塞王内徙出于本王自请 ,成祖只是顺水推舟而已 ;永乐时留在北边的其他塞王可起拥有护卫以壮边防声威之效 ,在定位上与洪武末年的安边保国不同     

甲骨文祭祀动词句法语义研究

~~甲骨文祭祀动词句法语义研究@贾燕子$漳州师范学院中文系!福建漳州363000~~~~[1]邵敬敏汉语语法的立体研究[M ]北京:商务印书馆,2000     

当代藏族文学的多元文化背景与作家民族文化身份的建构

当代藏族作家的创作面临多元文化背景,多元文化背景成为藏族作家创作的大语境。如何对待传统文化,实现藏族文化的现代性转换等问题成为当代藏族作家文化身份建构的首要问题。藏族当代作家既要大力弘扬民族文学,又要在重建中国文学中发挥作用;既要面向全球化,又要增强本土认同。努力使当代藏族文学既借全球化话题和语境获得新的增长空间,又保持民族的审美经验传统和民族文化的独立性。     

文学观念向他律的倾斜与越界--评20世纪30年代初前后六七年间文学观念的论争(上)

文学的自律、他律问题早在20世纪初就已提出.五四新文化运动后一个时期,文学自律的一面探讨不多,主要是争论他律的应有的方面,以确立新文学的性质与方向,建立新的文学观念,自属文学内涵的应有之义.但自20年代下半期从文学革命走向革命文学之后,马克思主义文学理论与俄国的无产阶级文化派及其余脉的各种文学思想,都被当成无产阶级文学思想介绍了过来,形成了20年代末、30年代初的中国文艺界的多次大争论,造成了文学观念向他律的倾斜与严重的越界.其中的一系列主导思想,后来以权威的形式被沿袭与巩固了下来.     

袁世凯与清末政治近代化

在清末政治近代化过程中,袁世凯积极投身其中,与张之洞、周馥联衔上奏立宪,支持五大臣出洋考察政治,参与官制改革,推动资政院设立,在直隶搞地方自治。其活动客观上推动了清末政治近代化,在中国近代产生了重要影响。