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从信息学的角度,对人(Homo sapiens)的117个蛋白质和大肠杆菌(Ecoli)的185个蛋白质的各二级结构相对应的mRNA序列中的密码子上下文关联、蛋白质序列中氨基酸上下文关联作了统计分析,计算了各二级结构中密码子(氨基酸)上下文关联的信息剩余.结果显示,同义密码子关联有着不同于氨基酸关联偏好的反常现象,人和大肠杆菌蛋白质中反常的密码子分别占19%、16%左右;并对大肠杆菌中的稀有密码子的关联进行了讨论,发现稀有密码子的关联偏好Sheet和Coil二级结构. 相似文献
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密码子前后双碱基关联与蛋白质二级结构的关系 总被引:1,自引:0,他引:1
对入(Homo sapiens)117个蛋白质和大肠杆菌(E.coli)的87个蛋白质的各二级结构相对应的mRNA序列中的密码子前后双碱基关联作了统计分析,分析发现它们的使用对不同种属蛋白质二级结构有不同的偏好,对同一种属蛋白质的不同二级结构也有不同的偏好,经过分析与比较,说明密码子前后双碱基关联也可以作为蛋白质结构预测的一个信息. 相似文献
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