代价敏感的GEP分类算法实现

在数据挖掘领域中,通常以分类精度作为分类算法效果的评估标准。这一标准是建立在假设任意一实例被误分类为任意类时都具备同样代价的基础上的。当此假设不成立时,直接使用传统分类方法就无法取得良好的分类和预测效果。针对这一问题,通过改进编解码方法以及在适应度函数中集成样本的不同误分类代价,提出了一种基于基因表达式程序设计的代价敏感分类算法(CSC-GEP),并在三个UCI数据集上对该算法进行了测试,实验结果表明CSC-GEP是一种有效的代价敏感分类算法。     

核酸序列的亲—疏水表示与相关分析

把核酸序列表示为单核苷酸－疏水标度序列并定义了相关函数，把核酸序列分为１０大类，求出每一类序列中外显子部分与内含部分各阶相关函数的平均值。结果表明，相关函数平均值与生物进化明显相关性。外显子部分有明显的３，６，９，…阶正相关，内含子部分有明显的２，４，…阶相关。     

集成化数据分析在生物标志物发现及个性化医疗上具有优势

过去20年基因组的革命提供给医药公司无以数计的潜在药物靶标。创造强有力的新药来作用这些靶标已经迫在眉睫。然而,大多数低挂水果已经被采摘,药物开发因此变得越来越困难。为了获得美国食品药品管理局(FDA)批准,新药必须证明其安全性和有效性,特别是当新药与现存药物进行比较时。     

谈谈真核生物与原核生物的基因表达过程的区别于共同点

高中生物教学中原核生物和真核生物有关的知识既是面广又是琐碎，学生对这一方面的知识的掌握情况很不透彻，而且是高考当中每年都涉及相关知识点的基础知识的考察，是很重要考点，尤其是基因表达的过程本来内容很抽象，再加上不同细胞中基因的结构及表达过程具有相同之处也有一定的区别，之所以学生对这一方面的知识的掌握难上加难。在真核生物体细胞和原核生物体细胞内基因的表达知识由系统性的总结和讨论，学生对真核原核细胞的基因表达的知识够正确的认识和了解有所帮助。     

疾病的真相

关于疾病的误区 健康和疾病在本质上是一样的，都是基因在一定环境下表达出来的一种生理状态，当基因表达异常时。人的身体便不能继续维持原有的平衡来调节和修复自己。无论是高血压、糖尿病，或者肿瘤，基因的异常表达是任何疾病的根源。     

耐力训练大鼠心肌基因谱改变及壳寡糖预处理效应

研究大强度耐力训练大鼠心肌组织基因表达谱的改变,筛选与心肌损伤过程相关的差异表达基因;观察壳寡糖预处理效应,探讨壳寡糖作为抗疲劳强力因子保护心肌结构和功能的分子机制.分别从对照组、壳寡糖处理组、耐力训练组SD大鼠的心肌组织中抽提总RNA.Cy3、Cy5荧光标记,反转录分别合成cDNA探针后,与含有12 000个基因的SBC大鼠高密度12K基因表达谱芯片杂交.杂交信号经扫描后,Genespring软件分析表达信号.差异表达基因共616个,大强度耐力训练组差异表达基因157个,其中上调141个,下调17个;壳寡糖处理组差异表达基因459个,其中上调183个,下调276个,涉及细胞凋亡差异表达基因有36个,下调24个,上调12个.结论：耐力运动所引起的心肌结构和功能的积极适应甚或心肌损害都是由众多基因共同调控的复杂过程.壳寡糖能调控大强度耐力训练大鼠心肌组织多种功能类别基因群表达水平,从分子水平揭示了壳寡糖保护大强度耐力训练对大鼠心肌造成不良影响的作用机制.     

胎教的智力开发功能质疑

本文对当前胎教中出现的认为胎教可以提高胎儿智力，使胎儿变得更聪明的偏向提出了质疑。认为胎教不能改变胎儿智力遗传信息和提高胎儿基因表达水平，因而不能从遗传上提高胎儿智力；胎教受宫内环境限制与胎儿没有语言的影响，也不能从社会文化教育上去提高胎儿智力，而决定智力发展的正是这二类因素。文章指出智力胎教是一种“超早期教育”，对胎儿不适时也不合理，我们提倡的仍应是母教式的胎教     

基于朴素基因表达式编程挖掘紧致函数

基因表达式编程(GEP)是一种基因型和表现型相分离的进化新模型,为了挖掘紧致的函数关系,分析了进化系统各因素对挖掘紧致函数的影响,提出了带紧致压力的适应度函数来进化函数紧致解。实验表明,带有紧致压力的适应度函数能自动进化计算机程序,适合挖掘的紧致关系,在挖掘紧致函数中,朴素基因表达式编程(NGEP)比GEP提高效率21.7%,与不带压力的系统相比,GEP的平均压缩了31.2%,NGEP系统平均压缩了42.5%;NGEP较GEP更容易发现紧致解,且函数表达形式更容易理解,丰富了NGEP理论.     

基于SOM网络的基因表达数据聚类分析

提出了用自组织映射(SOM)网络对生物信息学中基因表达数据进行聚类分析的方法。用SOM网络对酵母基因表达数据进行聚类。通过对映射结果的分析,表明SOM网络有较高的分类正确率,用于基因表达数据的聚类分析是行之有效的。     

酸性成纤维细胞生长因子促进灼伤面修复的试验研究

目的探讨酸性成纤维细胞生长因子(aFGF)与组织创伤修复的关系。方法运用NS-FⅡ型多功能光谱治疗仪器建立微波灼伤动物模型,分别用RT -PCR法和免疫组织化学方法检测创面组织中内源性aFGF基因表达。结果伤后12h创面皮肤组织中aFGF基因表达增加,并于伤后48h达高峰,伤后96h表达逐渐减少。结论组织损伤后内源性的aFGF mRNA表达具有可逆性,且其表达强度变化与组织损伤修复过程是一致的。