DNA分子近邻互补链碱基的非线性效应

DNA分子近邻互补链碱基的非线性动力学效应研究，综述了Yomosa及Zhang模型，并在改进后的平面转子模型基础上，利用阶乘矩分析方法分析了平面转子模型的非线性效应，结果说明该模型更好的近似性．     

链霉菌查尔酮合成酶基因克隆及原核表达载体构建

根据Genbank数据库已知的链霉菌的查尔酮合成酶基因的保守区设计chs基因特异简并引物,土壤总DNA为模板,利用PCR技术扩增得到该l条chs基因编码区,通过TA克隆、测序和同源比对及进化分析表明:该基因为放线菌来源chs基因.分别在该基因5’末端和3’末端分别引入的限制酶NcoI和EcoR I酶切位点,利用上述2种限制酶分别酶切导入到psimple-T/chs载体和原核表达pET32a,凝胶回收目的片段后,将二者连接并转化大肠杆菌感受态细胞,转化子经菌液PCR筛选、双酶切鉴定后,3730测序结果表明,该基因全长编码区为1089 bp,推测该基因编码全长为362个氨基酸残基,等电点(PI)为5.41、分子量为3 965道尔顿含有CHS保守功能区的酸性蛋白质.分析表明,该基因与Streptomyces lividans来源的查尔酮合成酶RppA基因核苷酸相似性高达93％,氨基酸序列相似性高达87.70％.测序结果表明,该基因已经成功插入到pET32a载体中.     

多通道DNA测序仪的新型设计

目前大多数商品化的DNA测序仪的信号检测系统是基于CCD或PMT。基于CCD的系统需要对CCD进行制冷,其造价相对较高且灵敏度相对较低;基于PMT的系统使用机械扫描来实现多通道检测,其工作稳定性相对较低且工作的机械噪音大。本文提出了新型的DNA测序仪,它采用PMT共焦荧光系统,通过f-θ透镜和光学扫描来实现多通道并行检测。在此新系统中采用标准双链DNA样品:pBR322/HaeIII(使用TO染料)进行了毛细管电泳实验,测得系统的检测限可达:1.1841×10-11mol/L。新型DNA测序仪的工作机械噪声相比基于机械扫描的系统要低得多,且工作稳定性和灵敏度也很高。此系统可应用于基于激光诱导荧光的毛细管阵列和多通道微芯片的电泳检测。     

从群体遗传的DNA线索看东乡族族源问题

DNA分析技术的发展为进行民族识别和分析民族起源、迁徙、流动、融合提供了新手段。本文在国内外首次应用D13S317基因座第 11号等位基因频率指标 ,计算了东乡族群体遗传动态数据。结果发现 ,东乡族和回族遗传距离很近 ,且东乡族中具有白种人血缘混杂。结合其他有关资料 ,我们认为东乡族的起源与元代蒙古军带来的中亚工匠、签军有关 ,亦与当地蒙古族、回族、藏族人群的融合有关。本文的研究结果可以为民族研究提供群体遗传方面的线索     

Generalized Augmentation to Control the False Discovery Exceedance in Multiple Testing

Abstract.  A new multiple testing procedure, the generalized augmentation procedure (GAUGE), is introduced. The procedure is shown to control the false discovery exceedance and to be competitive in terms of power. It is also shown how to apply the idea of GAUGE to achieve control of other error measures. Extensions to dependence are discussed, together with a modification valid under arbitrary dependence. We present an application to an original study on prostate cancer and on a benchmark data set on colon cancer.     

Retrospective change detection in categorical time series

The aim of this paper is to propose methods of detecting change in the coefficients of a multinomial logistic regression model for categorical time series offline. The alternatives to the null hypothesis of stationarity can be either the hypothesis that it is not true, or that there is a temporary change in the sequence. We use the efficient score vector of the partial likelihood function. This has several advantages. First, the alternative value of the parameter does not have to be estimated; hence, we have a procedure that has a simple structure with only one parameter estimation using all available observations. This is in contrast with the generalized likelihood ratio-based change point tests. The efficient score vector is used in various ways. As a vector, its components correspond to the different components of the multinomial logistic regression model’s parameter vector. Using its quadratic form a test can be defined, where the presence of a change in any or all parameters is tested for. If there are too many parameters one can test for any subset while treating the rest as nuisance parameters. Our motivating example is a DNA sequence of four categories, and our test result shows that in the published data the distribution of the four categories is not stationary.     

如何发现DNA是生命的遗传物质

从核酸的发现到DNA双螺旋结构模型建立历时80余年,人类最终确认了DNA是生命的遗传物质,解决了一个生命科学研究中极其关键的重大问题。因此,对此段历史的研究具有重要意义。全面回顾此间发生的对揭示DNA的结构和功能具有重要影响的事件,包括米歇尔发现核酸、列文提出＂四核苷酸假说＂、格里菲斯等人的转化实验、査伽夫提出碱基配对规律,以及沃森和克里克建立DNA双螺旋结构模型,在此基础上阐述人类发现DNA是遗传物质的研究历程,进而探讨科学研究的规律。     

品牌竞争力的DNA模型解析

通过建立品牌竞争力的DNA模型对品牌竞争力进行了探索。DNA模型以品牌显性竞争能力和隐性竞争能力为双链，形成双螺旋结构，并以品牌市场能力、品牌领导能力、品牌创新能力和品牌文化能力为碱基，形成具有生物活性的DNA结构，从而打造出具有独特性和可遗传性的竞争优势。最后，用DNA模型对海尔的品牌竞争能力进行分析，清晰地呈现了海尔品牌的强势基因，为企业提升品牌竞争力提供了一种分析方法。     

从12SrRNA部分基因序列探讨鳄的系统发生关系

本文用常规方法测定了雅卡凯门鳄（caiman yacane）、新几内亚鳄（crocodylus novaeguineae）等2种鳄类的约400bp的mtDNA12SrRNA基因片段的部分序列，所测序列与GenBank中的其他18种鳄类的12SrRNA基因相应片段同源序列一起经Clustal X1．8软件进行比对，并以乌龟（chinemys reevesii）为外群，用ClustalX（1．8），Mega2软件以及paup软件将这20种鳄的12SrRNA基因部分序列进行比对后构建了20种鳄的进化关系树，并分别用NJ树，MP树探讨它们之间的系统发生关系。其结果显示：食鱼鳄属Gavialis与马来假食鱼鳄属Tomistoma的亲缘关系较近，构成姐妹群并位于鳄科分支的基部。非洲窄吻鳄（Crocodylus cataphractus）与骨喉鳄（Osteolaemus retraspis）形成姐妹群，它们的亲缘关系比与其它真鳄类的关系更近，赞同非洲窄吻鳄应从鳄属中独土出来归属于长吻鳄属Mecistops的观点，因此鳄科包括鳄属、骨喉鳄属和长吻鳄属，它们的关系为（鳄属（骨喉鳄属，长吻鳄属））。鼍科4属中凯门鳄属与黑鳄属关系最近，接下来的是古鳄属、鼍属，而且鼍属是鼍科中起源最早的类群。扬予鳄（Alligator sinensis）与密河鳄（Alligator mississippiensis）较近的亲缘关系得到支持，但它们并没有形成姐妹群关系。