蛋白质折叠速率预测模型的鲁棒性分析

现代分子生物学中的重要研究内容之一,是通过对蛋白质折叠速率的精确预测来解析蛋白质折叠机制。能够发现影响蛋白质折叠速率的新因素,对于研究蛋白质折叠具有重要意义。最近,本研究组给出一个研究蛋白质折叠速率的新参数——累积主链扭角(Cumulative Backbone Torsion Angles,CBTA)。已有的研究表明,CBTA与蛋白质折叠速率之间有很高的相关性。在新近收集的包含112个单域球蛋白质折叠速率的实验资料集上,从预测精度、鲁棒性和泛化能力等几个方面,全面地比较了包括CBTA模型在内的四个典型的折叠速率预测模型。结果表明,CBTA模型表现最好。同时还表明,就目前的实验数据量不足以构建基于多因素的蛋白质折叠速率预测模型。