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一种预测膜蛋白类型的新方法
引用本文:王婷,胡秀珍.一种预测膜蛋白类型的新方法[J].内蒙古工业大学学报,2009,28(3):177-181.
作者姓名:王婷  胡秀珍
作者单位:[1]内蒙古工业大学理学院,呼和浩特010051 [2]长治职业技术学院,山西长治046000
基金项目:内蒙古自治区高等学校科学研究项目(NJZY08059)
摘    要:本文以紧邻氨基酸出现的频数为参数,用离散增量方法预测了6种类型膜蛋白.并用自洽、留一法和独立检验三种方法对算法进行检验,均获得了较好的预测效果.

关 键 词:膜蛋白  离散增量  紧邻氨基酸

A NEW ALGORITHM FOR PREDICTING MEMBRANE PROTEIN TYPES
Institution:WANG Ting,HU Xiu-zhen(1.School of Science,Inner Mongolia University of Technology,Hohhot 010051,China;2.Changzhi Professional Technology College,Changzhi,Shanxi 046000,China)
Abstract:Six kinds of membrane proteins are predicted by applying the algorithm of the increment of diversity,with the number of adjacent residue-pair in the sequences of protein taken as the parameter.Self-consistency,jackknife and independent dataset test methods are used for checking.The results of prediction are proved to be fairly good.
Keywords:membrane protein  increment of diversity  adjacent residue-pair
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