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| 细菌σ54启动子序列分析与预测 | |
| 引用本文： | 丁辉,邓恩泽,陈伟,林昊.细菌σ54启动子序列分析与预测[J].电子科技大学学报(社会科学版),2015(1):147-149. |
| 作者姓名： | 丁辉 邓恩泽 陈伟 林昊 |
| 作者单位： | 电子科技大学生物信息学中心;河北联合大学基因组学与计算生物学中心 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金(61202256,61301260,61100092);中央高校基本科研业务费(ZYGX2012J113,ZYGX2013J102) |
| 摘 要： | 对实验确定的168条σ54启动子序列进行保守性分析,获得两个保守的区域-24区域和-12区域,均为最保守的功能元件。选取保守性最大的17个保守位点的三联体频数作为参数,引入伪计数构建位置权重矩阵,对168条σ54启动子进行预测,分别从编码区和汇聚非编码区共选取168条序列组成阴性集。使用Jackknife交叉验证法对模型进行检验,整体准确度达到82.0%,为σ54启动子的理论和实验研究提供新信息。 |
| 关 键 词： | 细菌 保守性 位置权重矩阵 启动子 |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ | |