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大肠杆菌同义密码子重复序列中密码子的使用
引用本文:李永香,李宏,王芳平. 大肠杆菌同义密码子重复序列中密码子的使用[J]. 内蒙古工业大学学报, 2006, 25(1): 5-11
作者姓名:李永香  李宏  王芳平
作者单位:内蒙古大学理工学院物理系 呼和浩特010021
基金项目:国家自然科学基金(10147204),内蒙古自然科学基金项目资助
摘    要:以大肠杆菌基因组为样本,研究同义密码子重复序列与ORF全序列中各密码子相对使用频率的差异,分析同义密码子重复序列中密码子重复的偏好.结果表明部分密码子的使用与ORF全序列中的使用不同,并非所有密码子的使用与基因表达水平正相关;同义密码子重复序列中密码子重复具有偏好性,部分密码子重复在四联体中有位置偏好.同义密码子重复的最大长度与所编码的氨基酸亲疏水性质、简并度及构成密码子的碱基性质有关.

关 键 词:大肠杆菌基因组  同义密码子重复序列  同义密码子相对使用  偏好
文章编号:1001-5167(2006)01-0005-07
收稿时间:2005-10-15
修稿时间:2005-10-15

CODON USAGE IN THE SYNONYMOUS CONDON REPEAT SEGMENTS OF E. coli
LI Yong-xiang,LI Hong,WANG Fang-ping. CODON USAGE IN THE SYNONYMOUS CONDON REPEAT SEGMENTS OF E. coli[J]. Journal of Inner Mongolia Polytechnic University(Social Sciences Edition), 2006, 25(1): 5-11
Authors:LI Yong-xiang  LI Hong  WANG Fang-ping
Affiliation:Department of Physics, College of Sciences and Technology, NeiMongol University.Hohhot 010021, PRC
Abstract:
Keywords:genome of E.coli  synonymous codon repeat sequence  relative synonymous codon usage  bias
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