| 蛋白质结构与密码子上下文关联的信息论研究 |
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| 引用本文： | 胡秀珍,肖奕. 蛋白质结构与密码子上下文关联的信息论研究[J]. 内蒙古工业大学学报, 2003, 22(1): 6-11 |
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| 作者姓名： | 胡秀珍 肖奕 |
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| 作者单位： | [1]内蒙古工业大学基础部，内蒙古呼和浩特010062 [2]华中科技大学物理系．武汉430074 |
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| 基金项目： | 内蒙古基金资助项目(20001301) |
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| 摘 要： | 从信息学的角度，对人(Homo sapiens)的117个蛋白质和大肠杆菌(Ecoli)的185个蛋白质的各二级结构相对应的mRNA序列中的密码子上下文关联、蛋白质序列中氨基酸上下文关联作了统计分析，计算了各二级结构中密码子(氨基酸)上下文关联的信息剩余．结果显示，同义密码子关联有着不同于氨基酸关联偏好的反常现象，人和大肠杆菌蛋白质中反常的密码子分别占19％、16％左右；并对大肠杆菌中的稀有密码子的关联进行了讨论，发现稀有密码子的关联偏好Sheet和Coil二级结构．
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| 关 键 词： | 蛋白质二级结构 同义密码子 氨基酸 上下文关联熵 信息剩余 |
| 文章编号： | 1001-5167(2003)01-0006-06 |
STUDIES OF THE CONTEXT CORRELATION OF CONDONS IN PROTEIN STRUCTURES |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | secondary structure synonymous codon amino-acid context correlation entropy remnant information |
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