CARfinder:一个用于识别染色体变异区域的平台软件

癌症是危害人类健康的主要恶性肿瘤之一,因此,研究癌症发病机制,发现癌症的发病的分子学基础,挖掘致病因素,对有效预防和治疗癌症,具有重要的意义。目前,在癌症中发现了大量的染色体畸变现象,已有研究表明,染色体的结构变异会导致癌症的发病与发展,因此识别癌症中的染色体变异现象对了解癌症的发病机制,阐明癌症发生的分子机制有着至关重要的作用。随着,海量的生物学数据的产生,差生了大量的、大规模的全基因组的表达谱芯片数据,这为从全基因的角度识别染色体变异区域提供了可能。为此,我们开发了一个利用表达谱数据识别染色体变异区域的软件CARfinder,并将该软件应用于乳腺癌数据中得到了很好的识别结果。     

应用差异基因的上下文知识的数学方法识别肝癌中变异的染色体区域

近些年来在许多癌症中都发现存在染色体的结构变异现象,如染色体的插入和缺失等。识别变异的染色体区域对疾病诊断具有重要意义。目前已有一些方法用于识别与疾病相关的染色体区域,但是他们主要集中于研究染色体上该区域内的表达谱上的基因,而没有考虑到非表达谱上基因,及表达谱上基因的相关基因的表达情况。本文提出一个融合差异基因上下文知识识别变异的染色体区域的方法。利用我们的方法处理了3套表达谱数据,挖掘出了与肝癌相关的扩增和缺失的染色体区域并获得肝癌相关致病基因,如8q11.21、14q32.11和Xq28的扩增。该方法可以应用于分析各种类型芯片来挖掘致病的染色体区域,可作为挖掘疾病中染色体变异区域的一种有效工具。     

科技新知

我国首次完成大熊猫基因组精细图 国家林业局公布消息称，大熊猫基因组测序研究项目正式完成，大熊猫基因组精细图已获绘制。测序研究结果表明：大熊猫有染色体二十一对，基因组大小二点四G，重复序列含量百分之三十六，基因两万多个。大熊猫基因组仍然具备很高的杂合率和较高的遗传多态性；在已经进行全基因组测序的物种中，大熊猫基因组与狗的基因组最接近。数据分析结果同时还进一步支持了大多数科学家所持的“大熊猫是熊科的一个亚种”这一观点，证明了熊科内部各类群的分类情况。     

供应链金融风险管理研究综述

近年来,供应链金融作为一项金融创新服务在我国发展迅速,已经成为商业银行与供应链中核心企业增强竞争力、拓宽发展空间的一个重要领域,同时也为供应链中上小游企业特别是中小企业提供了新的融资渠道。文章依据风险管理的一般分析方法,从供应链金融的概念模式、风险识别、风险评估与风险识别等方面对国内外供应链金融相关文献进行梳理,简要评价了现有文献的贡献与不足,并对之后的研究方向进行展望。希望为学术界相关研究提供参考。     

产业集聚理论述评

产业集聚理论经过了一个多世纪的研究，已经形成了二．个较为完善的理论体系，产生了大量的成果。而产业集聚又是实现一个地区产业升级以及促进区域经济发展的重要途径。基于此，本文阐述了国内外学者在研究产业集聚过程中所取得的具有代表性的成果，为相关学者进一步研究产业集聚理论与实证研究莫定了坚实的基础，从而为促进区域经济持续稳定的发展提供了理论的指导。     

科学家发现人和黑猩猩基因功能区域差异只有百分之零点七五

国家人类基因组南方研究中心的科学家近日成功完成了人和黑猩猩基因序列差异的比较研究,结果发现,人和黑猩猩基因的功能区域差异只有0.75%。我国科学家的发现为探索人类的起源及其独特的性状特征提供了重要的科学参数和新的研究线索,同时也为识别重要疾病易感基因的研究开辟了新的途径。国际权威学术期刊《美国科学院院报》日前发     

科学家首次绘出大鼠基因组图

近日,美国和欧洲的科学家兴奋地宣布,他们第一次成功地绘制出了大鼠基因组草图.由于该基因组与人类基因组非常接近,它的破译将有助于揭开人类遗传和进化中的大量秘密,而且有利于推进人类疾病治疗以及新药研发,所以这一成果堪称人类医学史上的一个重大里程碑.     

简析农村小额寿险问题

自2008年6月在9个省份的农村试点小额人身保险以来,农村小额寿险因其与传统寿险有很多相同之处,相对简单、保费低廉得到了迅速的发展。然而,在推广的过程之中不可避免的也遇到了很多问题,本文先从需求与供给两个方面简析农村小额寿险所面临的问题,进而探究解决的方法。一、研究意义及现状根据国际贫困扶住协商组织(CGAP)的界定,小额保险(Micro-Insurance)是为低收入人群提供特定风险事件所引起的风险     

成功破译人类6号染色体

英国科学家日前成功破译了人类第6号染色体,并识别出了多个引发人类疾病的基因.6号染色体解密,对人类征服顽症有何意义?医学基因组学国家重点实验室主任、上海血液学研究所执行所长陈赛娟表示,6号染色体解密,为研究某些疾病的发病奠定了基础."锁定"致病基因是研究疾病发病的第一步,但像肿瘤、心脏病、高血压等一些多基因疾病与多个基因相关,这就要求人类进一步对全部24条染色体进行逐一解读;此外,对一些遗传性疾病的研究还必须掌握其"家系"情况.     

区域旅游整合开发的基本思路

区域旅游整合是一个长期以来探讨的问题,旅游学界对为什么要进行区域旅游整合进行了大量的探讨.结合一些学者的相关研究和近年来我国旅游业的实践发展,本文对区域旅游整合的一些基本内容进行了重新总结,对区域旅游整合提出了一些基本思路.     

基于在线评论的区域需求偏好识别方法

用户需求存在着区域差异，识别区域需求偏好是企业区域化经营策略的决策基础。为此，本文提出了一种基于在线评论的区域需求偏好识别框架。首先，从在线评论中提取产品特征，并判定产品特征的情感极性；然后，基于特征情感计算客户的产品满意度；最后，利用假设检验的方法识别特征情感极性和产品满意度的区域差异。为了验证框架的有效性，本文利用汽车之家网站上的汽车产品评论数据进行分析。实验结果表明，油耗、空间、外观和内饰等特征的情感极性以及产品满意度受区域因素的影响十分显著。研究结果建立起产品特征情感极性和产品满意度与区域特征的关联联系，为企业的区域化产品设计与营销策略提供理论支撑。     

科学家首次绘出大鼠基因组图

近日,美国和欧洲的科学家兴奋地宣布,他们第一次成功地绘制出了大鼠基因组草图。由于该基因组与人类基因组非常接近。它的破译将有助于揭开人类遗传和进化中的大量秘密,而且有利于推进人类疾病治疗以及新药研发,所以这一成果堪称人类医学史上的一个重大里程碑。据英美媒体4月1日报道,美国和欧洲科学家3月31日联合宣布了这个重要的研究成果,并在最新一期《自然》杂志上公布了包括大鼠90%遗传物质的基因组草图。大鼠是被破译基因组的第三种哺乳动物,此前科学家还破译了人类和老鼠的基因组。科学家介绍说,大鼠与人类有90%的     

医学科学的六个新课题

一、人类基因组计划与基因组医学“基因组医学”这一新概念随DNA序列图的基本完成而诞生,它囊括基因结构错误或功能异常所引发的疾病及该类疾病的基因诊断与基因治疗,基因图谱的识别与疾病防治的关系,基因靶点药物的发现与应用,医生对基因组知识的     

中小企业生存与发展的理论基础

中小企业不是规模小的大企业,中小企业政策及其研究工作需要体现小企业的本质特点,理解中小企业生存与发展的理论基础。本文在大量经典文献资料的基础上,对一些相关理论观点进行了归纳、整理,目的在于识别影响和决定中小企业成长的关键因素,理解和把握中小企业的生存发展规律,进而给从事创业的企业家和中小企业经营管理者提供支持,为政府制订面向中小企业的支援体系建设提供理论依据,为在我国开展实证研究提供理论框架。     

浅谈新时期人事档案管理

目前在人事档案管理的过程中,信息是相关管理过程中主要的一个来源。因此就目前人事档案管理来看,人事档案是对于人才管理的一个重要工具,是识别人才的一项关键步骤。优化人事档案管理模式、更新人事档案内容、合理开发人事档案信息资源,为人力资源建设提供有效服务具有十分重要的现实意义。本文就相关人事档案管理的资料进行了研究,主要就人事档案管理过程中存在的一些问题进行探讨。     

医学科学的六个新课题

一、人类基因组计划与基因组医学 "基因组医学"这一新概念随DNA序列图的基本完成而诞生,它囊括基因结构错误或功能异常所引发的疾病及该类疾病的基因诊断与基因治疗,基因图谱的识别与疾病防治的关系,基因靶点药物的发现与应用,医生对基因组知识的了解与应用,等等.     

港口物流共生系统的构建

港口作为现代物流链中一个不可替代的重要节点,已成为整合生产要素功能的平台,完成了整个物流系统中许多基本服务和衍生的增值服务;已成为区域市场与国内外市场的节点,区域经济与国内外经济的交汇点,是所在地区和城市经济发展的新的增长点。港口物流利用港口集货、存货、配货、多式联运的特长,以区域经济为中心,发挥其对港口周边区域物流活动的辐射能力,为用户提供多功能一体化的综合物流活动。港口物流涵盖了物流活动中所有的作业环节,港口本身就是一个物流基地、物流枢纽、物流节点,是物流相关企业的集群。港口因其独特性资源禀赋和业务的相关性,产业的集群现象日趋明显。     

成功破译人类6号染色体

英国科学家日前成功破译了人类第6号染色体,并识别出了多个引发人类疾病的基因。6号染色体解密,对人类征服顽症有何意义?医学基因组学国家重点实验室主任、上海血液学研究所执行所长陈赛娟表示,6号染色体解密,为研究某些疾病的     

介绍制备微核标本的几种常用方法

大量新的化合物合成,原子能的利用,多种工业废物的大量排放,使生物体的生存环境发生了改变,对生物的遗传进化效应产生了深远影响。这使得具有一套高灵敏度、操作技术甚为简单的测试系统来监视环境致变物的诱变活性以及对人体和其他动物的遗传危害显得甚为重要。真核类生物细胞微核测试技术成为一种较为理想的方法。微核(MCN)是真核类生物细胞经辐射或化学诱变剂的作用而产生的一种游离于主核之外的异常结构,和中期细胞染色体畸变情况一样,微核率的大小和用药的剂量或辐射累积效应呈正相关,同时染色体畸变率与微核之间相关非常显著。因此可…     

多车型车辆路径问题的量子遗传算法研究

本文在分析现有文献中多车型车辆路径问题中车辆使用优先原则的基础上,将车辆使用费用分为固定费用和油耗费用,并建立以配送总费用最小为优化目标的数学模型。设计量子遗传算法对模型进行求解,采用量子比特位设计染色体结构,改进遗传算法中交叉与变异算子,避免优秀基因不被破坏,设计快速寻优机制与最优保留机制,增强的求解效率。最后,结合算例对模型和算法进行了检验与分析。